Nat Biotechnol：研究不能重复？可能是HeLa细胞系“变异”了

HeLa巨噬细胞之前在欧美的许多科学实验培训了多达70年，并且长期以来被视为是无限供应的不衰的相近巨噬细胞。然而，2月末18日发表在《Nature Biotechnology》新闻周刊上的一项新数据已经有，巨噬细胞在不尽相近科学实验二者之间假定很大相似之处，这造成了了对巨噬细胞系数据分析重复使用普遍性的质疑。“我很后悔看到这项数据分析，但在举例上我并不感到惊讶，”安德森安德鲁妮结核病里心的底物生物科学家Prasad Jallepalli真是，他从未策划这项数据分析。这并不是HeLa巨噬细胞系自诞生以来第一次显露现多种不同的报导：直到现在，其他数据分析一个小组也证明了HeLa巨噬细胞衰异微二者之间在基因序列和RNA表述的在在相似之处。这项简介数据分析首次全面分析了各种HeLa衰异微的基因突变衰异（不尽相近批次的HeLa巨噬细胞系家庭在欧美的各个科学实验），并且首次证明基因突变异质普遍性导致了蛋白表述和表型的衰化。HeLa巨噬细胞“衰了”？在这项数据分析里，数据分析部门从6个国家所的13个科学实验查阅了14份HeLa结果显示，并在相近的科学实验先决条件下同步进行培训。他们首先定量了基因拷贝数衰异，阐述了它们基因组二者之间的在在相似之处。结果发现，HeLa衰异微二者之间，之外是CCL2和Kyoto衰异微二者之间假定着很大的异质普遍性。全面性的已经有，许多这些基因突变相似之处生成为mRNA产生的衰化，并且在较少程度上生成为蛋白丰度的衰化。数据分析部门报告真是，HeLa CCL2和Kyoto巨噬细胞系的转录组和蛋白组谱彼此二者之间的相似之处，就像来自两种不尽相近类型其组织的抗体系二者之间的相似之处一样。HeLa衰异微在培训过程里湿润速度也不尽相近，一些巨噬细胞群需17.5不间断才能翻倍，而另一些巨噬细胞在相近的培训先决条件下需话费最少32不间断。它们对沙门氏菌菌株感染的反应也有所不尽相近：与其他两种衰微相比，一种衰微对菌株感染的敏感普遍性较低，数据分析部门将其归因于低水平的蛋白蛋白，这种蛋白蛋白在菌株转到肠道巨噬细胞里起起着。在一项单独的实验里，数据分析一个小组通过培训巨噬细胞系三个月末，来观察HeLa衰异微的基因表述是否会随着时长发生衰化。数据分析部门历史记录了后期巨噬细胞和晚期巨噬细胞二者之间基因表述相似之处大约6%。巴塞尔联邦理工学院底物系统生物科学数据分析所的Ruedi Aebersell教授是该数据分析的合着者，他真是，“即使在同一个科学实验里，这些巨噬细胞的相似之处和衰化速度也是并不惊人的。”他估计，如果一个数据分析生在新项目开始时用HeLa巨噬细胞系做了一个实验，并在六个月末后被要求重复使用这个实验，他们显然会得到不尽相近的结果。关于数据分析里的“可复制普遍性困境”的讨论大多数集里在自适应、数据分析方面的缺陷，以及作为主要飞轮因素的受空气污染或刷错标签的巨噬细胞系。但是Aebersell视为，HeLa巨噬细胞系和抗体系的生物科学相似之处显然是关键。为什么会“衰”？斯坦福大学的巨噬细胞生物科学家Tim Stearns视为有几个显然的原因可以暗示为什么巨噬细胞系在长时长培训下会发生衰化。首先，HeLa巨噬细胞是已知基因组不稳定的抗体，因此很显然随时长随机突衰。此外，它们还会在科学实验里受到各种湿润先决条件的影响，这显然会进一步巨噬细胞生物显露独有的特征。例如，他真是，类动物巨噬细胞的培训包括将其培训到感受到一个培训皿为止，从培训皿里抽走一部分巨噬细胞，然后将它们放到另一个培训皿里湿润，这一过程称为分裂。“每个人做这件事的方式则都有点不尽相近，”他真是道。简介这些发现，对于生命培训巨噬细胞的数据分析结果的暗示和重演普遍性有一定的意义。Aebersell和他的同僚在学术著作里指显露了几个具微的解决方案。首先，数据分析部门不应使用抗体系的后期传代，并必需在同一巨噬细胞系的不尽相近结果显示里重复使用同一巨噬细胞系的实验。更不可或缺的是，生物科学家不应确切地报告他们在给定的数据分析里使用的巨噬细胞系衰异微。